复旦大学附属中山医院(厦门)中心实验室

中心实验室概况

中心实验室是医院内集医疗、科研及教学于一体的综合性实验室,旨在进一步提高医院的医疗水平和科研能力,促进医疗技术和基础研究相融合,为开展科技攻关、学术交流和人才培养提供重要基地,并实现区域内医疗资源重新整合、优化资源配置。

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实验室承担工作

一、负责医院科研类实验室,包括中心实验室或平台实验室的运行,制定和完善中心实验室的各项管理制度和规范,履行实验室管理职责,保障仪器设备和实验技术的正常运行和质量控制,负责科研实验室固定资产管理,并根据各科室科研需求,统一调配科研实验资源,提高科研仪器设备使用效率,节约成本;

二、负责医院中心实验室现有科研仪器设备的管理和维护,尤其是大型精密仪器设备,负责中心实验室的科研人员准入,包括学生和各科室使用者的仪器使用前培训工作;并负责搭建和完善各大技术平台,为各临床科室与科研课题组提供必要的实验技术支撑;

三、负责科研实验室安全工作(含危化品管理),负责全院的实验安全教育和培训,定期进行安全检查和隐患排查,落实安全责任制;

四、积极配合院领导和相关部门,参与医院科研项目、重点学科和课题的申报、管理、监督、评估等工作;与各临床科室积极开展交流和合作,推动和配合临床科室开展科研工作。

仪器和技术平台

一、分子生物学与细胞生物学平台:提供细胞株/系的常规培养技术、原代细胞分离提取与培养鉴定、细胞增殖及毒性检测、细胞转染、细胞内基因表达、基因调控、基因编辑、细胞信号转导、细胞特殊染色、细胞免疫荧光实验、细胞迁移与侵袭、细胞凋亡/周期检测、流式细胞分析分选技术。

二、组织与病理学实验平台:提供组织处理、石蜡切片、冰冻切片、硬组织切片、HE染色、特殊染色、免疫组织化学染色、免疫荧光染色、细胞增殖检测、细胞凋亡检测、荧光多重标记、原位杂交检测等病理技术服务,对人体或动物的正常或病变的组织进行形态学和分子水平的观察和分析。

三、蛋白质化学与组学平台:拟开展成分分离分析、结构鉴定、药物定量、蛋白组学和代谢组学等分析测试工作。可满足有机化合物、蛋白质及酶解多肽、血样、尿样、细胞组织样、微生物培养液、植物提取液等待测样品检测。

四、测序与生信分析平台:为发展高通量测序、单细胞测序、空间多组学分析和表观遗传学分析等技术手段,对基因组、转录组、蛋白质组等层面的数据进行生物信息学处理和解读而提供的平台。开展基于microarray,RNA Sequencing或结合单细胞测序技术分析多种肿瘤中基因差异表达的生信分析,预期可提供核酸全自动提取、非接触超声波打断、文库构建、文库检测、核酸测序等基因组学相关技术服务。

五、重要仪器及管理人员

序号 仪器设备 A角 B角
1 Illumina高通量基因测序仪 孙华琴 王浙锋
2 BioRad ddPCR 数字定量PCR 王浙锋 孙礼祥
3 BD流式分析仪 孙礼祥 孙华琴
4 Roche LC480实时荧光定量PCR仪 蔡黎俊 杨亦淳
5 勤翔ChemiScope荧光及化学发光成像仪 蔡黎俊 孙华琴
6 BioRad Chemidoc成像仪 蔡黎俊 王浙锋
7 Thermo Cryostar NX50冰冻切片机 杨亦淳 孙礼祥
8 Promega微孔板发光检测仪 王浙锋 蔡黎俊
9 Thermo Multiskan全波长酶标仪 杨亦淳 蔡黎俊
10 Thermo applied biosystem热循环仪 孙礼祥 蔡黎俊

人员介绍

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汪进 博士

研究员,复旦大学临床医学院免疫学专业及生物与医药专业博士生导师。2015年至2023年期间为上海市(复旦大学附属)公共卫生临床中心PI。2003年在香港城市大学生物及化学系获博士学位。2004年至2010年期间,先后在美国国立卫生研究院(NIH/NIDDK)和美国德州大学 M.D.爱德森癌症研究中心从事博士后研究,其2010年获得美国The Anne Eastland Spears Fellowship in GI Cancer Research奖,2016年获上海市浦江人才和2020年获上海金山优秀人才学科带头人称号。研究领域为肿瘤和感染病的早期诊断和治疗机制研究,包括非编码RNAs在消化道肿瘤(肝癌和胰腺癌)和HIV合并肿瘤中发生发展过程中的作用和分泌机制。已在《Cancer Cell》、《Clinical Chemistry》、 《Cancer Letter》、《Carcinogenesis》、《Theranostics》、《Cancer Prevention Research》等国际核心学术期刊上发表50多篇SCI论文。近五年来已获得国家传染病重大专项子课题、国家自然科学基金面上项目、上海市科委自然科学基金、北京佑安肝病感染病医疗联盟项目等课题资助。

近两年发表文章:

1. Liu S#, He X#, Di Y#, Li Q#, Li F#, Chen L, Gao Y, Xu J, Yang S, Xu L, Corpe C, Ling Y, Zhang X, Xu J, Yu W, Wang J*. NamiRNA-enhancer network of miR-492 activates the NR2C1-TGF-β/Smad3 pathway to promote epithelial-mesenchymal transition of pancreatic cancer. Carcinogenesis. 2023; bgac102. doi: 10.1093/carcin/bgac102. (*Corresponding author).

2.  Liu S#, Di Y#, Li Q#, Ma Y, He X, Bai Z, Corpe C, Zhang X, Xu J, Wang J*. Whole transcriptome sequencing analysis of plasma lncRNAs identifies exosomal LINC01268 as novel prognosis biomarker for pancreatic cancer. Genes & Diseases. 2023. doi: 10.1016/j.gendis.2022.12.018. (*Corresponding author).

3. Xia QL, He XM, Ma Y, Li QY, Du YZ, Wang J*. 5-mRNA-based prognostic signature of survival in lung adenocarcinoma. World Journal of Clinical Oncology, 2023; 14(1): 27-39. (*Corresponding author).

4. Ma Y, He X, Di Y, Liu S, Zhan Q, Bai Z, Qiu T, Corpe C, Wang J*. Identification of prognostic immune-related lncRNAs in pancreatic cancer. Front Immunol. 2022; 13:1005695. doi: 10.3389/fimmu.2022.1005695. (*Corresponding author).

5. Bao J#, Ye J#, Xu J#, Liu S, Wang L, Li Z, Li Q, Liu F, He X, Zou H, Feng Y, Corpe C, Zhang X, Xu J, Zhu T, Wang J*. Comprehensive RNA-Seq Reveals Molecular Changes in Kidney Malignancy Among People Living with HIV.  Molecular Therapy: Nucleic Acids. 2022;29:91-101. (*Corresponding author).

6. Ma Y#, Li Q#, Chen J#, Liu S, Liu S, He X, Ling Y, Zheng J, Corpe C, Lu H*, Wang J*. Angiotensin-Converting Enzyme 2 SNPs as Common Genetic Loci and Optimal Early Identification Genetic Markers for COVID-19. Pathogens. 2022 Aug 22;11(8):947. doi: 10.3390/pathogens11080947. (*Corresponding author).

7. Ma Y, Di Y, Li Q, Zhan Q, He X, Liu S, Zou H, Corpe C, Chen L*, Wang J*. LncRNAs as epigenetic regulators of epithelial to mesenchymal transition in pancreatic cancer. Discov Oncol. 2022;13(1):61. doi: 10.1007/s12672-022-00522-0. (*Corresponding author).

8. Wang J*, Zou H, Corpe C. An observed association between angiotensin-converting enzyme 2 polymorphisms and COVID-19 severity in China. J Infect. 2022; 84(1): e21-e22. doi: 10.1016/j.jinf.2021.10.020. (*Corresponding author).

9. Wang Q, Hu Q, Ying Y, Lu C, Li W, Huang C, Xu W, Li Q, Qi X, Zhang X, Liu X, Du Z, Feng Y, Zhang Y, Li X, Ji Y, Zhang J, Wang J*, Chen L*, Huang Y*. Using Next-generation Sequencing to Identify Novel Exosomal miRNAs as Biomarkers for Significant Hepatic Fibrosis. Discov Med. 2021;31(164):147-159. (*Corresponding author).

10. Liu S, Li Q, Chu X, Zeng M, Liu M, He X, Zou H, Zheng J, Corpe C, Zhang X, Xu J, Wang J*. Monitoring Coronavirus Disease 2019: A Review of Available Diagnostic Tools. Front Public Health. 2021; 9:672215. doi: 10.3389/fpubh.2021.672215. (*Corresponding author).

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孙礼祥 博士

助理研究员,博士,毕业于厦门大学药学院,2019年至2023年期间在厦门大学从事博士后研究工作。获国家自然科学基金青年基金、中国博士后科学基金、厦门大学生命科学与人类健康学科群优秀博士后项目资助。在读期间荣获厦门大学傅鹰奖学金(2016年)及林鹏生态奖学金(2014年)。其已在《Oncogene》、《Cell Rep》等国际核心学术期刊上发表5篇SCI论文(均为一作或共一),主要研究涉及胰腺癌诊断生物标志物及潜在治疗靶点筛选和相关分子机制研究;皮肤的生理/病理机制研究包括伤口微环境中炎症因子信号对真皮成纤维细胞的调控作用,皮肤纤维化的性别差异机制研究,银屑病的免疫网络构建;以及膜蛋白转运调控和细胞信号转导相关方面研究包括囊泡运输调控与肿瘤发生/发展、癌细胞迁移、蛋白修饰以及胞内多信号交互网络等方面。

已发表文章:

1. Sun, L.#, Zhang, X.#, Wu, S., Liu, Y., Guerrero-Juarez, C. F., Liu, W., Huang, J., Yao, Q., Yin, M., Li, J., Ramos, R., Liao, Y., Wu, R., Xia, T., Zhang, X., Yang, Y., Li, F., Heng, S., Zhang, W., Yang, M., Tzeng, C. M., Ji, C., Plikus, M. V., Gallo, R. L. & Zhang, L. J. (2023) Dynamic interplay between IL-1 and WNT pathways in regulating dermal adipocyte lineage cells during skin development and wound regeneration, Cell Rep. 42, 112647.

2. Liao, Y.#, Sun, L.#, Nie, M.#, Li, J., Huang, X., Heng, S., Zhang, W., Xia, T., Guo, Z., Zhao, Q*. & Zhang, L. J*. (2023) Modulation of Skin Inflammatory Responses by Aluminum Adjuvant, Pharmaceutics. 15.

3. Sun, L.#, Liu, W. & Zhang, L. J*. (2019) The Role of Toll-Like Receptors in Skin Host Defense, Psoriasis, and Atopic Dermatitis, J Immunol Res. 2019, 1824624.

4. Sun, L.#, Xu, X.#, Chen, Y., Zhou, Y., Tan, R., Qiu, H., Jin, L., Zhang, W., Fan, R., Hong, W. & Wang, T*. (2018) Rab34 regulates adhesion, migration, and invasion of breast cancer cells, Oncogene. 37, 3698-3714.

5. Sun, L.#, Hu, X.#, Chen, W.#, He, W., Zhang, Z. & Wang, T*. (2016) Sorting nexin 27 interacts with Fzd7 and mediates Wnt signalling, Biosci Rep. 36, e00296.

6. 孙礼祥#,吴帅,张小薇,刘文杰,张凌娟*. 基于单细胞 RNA 测序探讨小鼠全层皮肤缺损创面中真皮成纤维细胞的生长因子调控网络[J].中华烧伤与创面修复杂志 2022, 38(7): 629-639. DOI:10.3760/cma.j.cn501225-20220215-00029. 北大核心收录期刊.

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蔡黎俊 博士

助理研究员,博士,毕业于厦门大学药学院,其研究方向涉及多组学技术在消化道肿瘤应用及肿瘤特异分子靶标的筛选,和肝病相关分子机制研究,重点关注肝星状细胞在肝病发生发展中的作用机制。

已发表文章

1. Baohuan Lian#, Lijun Cai#, Zhaoqiang Zhang#, Fen Lin, Zongxi Li, Xiao-Kun Zhang*, Fuquan Jiang*. The anti-inflammatory effect of Pien Tze Huang in non-alcoholic fatty liver disease. Biomedicine & Pharmacotherapy, 2022, 151: 113076.

2. Liqun Chen#, Alexander E. Aleshin#, Gulimiran Alitongbieke, Yuqi Zhou, Xindao Zhang, Xiaohong Ye, Mengjie Hu, Gaoang Ren, Ziwen Chen, Yue Ma, Duo Zhang, Shuai Liu, Weiwei Gao, Lijun Cai, Lingjuan Wu, Zhiping Zeng, Fuquan Jiang, Jie Liu, Hu Zhou, Gregory Cadwell, Robert C. Liddington, Ying Su & Xiao-kun Zhang*. Modulation of nongenomic activation of PI3K signalling by tetramerization of N-terminally-cleaved RXRα. Nature Communications, 2017, 8(1): 1-14.

3. Mengjie Hu#, Qiang Luo#, Gulimiran Alitongbieke#, Shuyi Chong, Chenting Xu, Lei Xie, Xiaohui Chen, Duo Zhang, Yuqi Zhou, Zhaokai Wang, Xiaohong Ye, Lijun Cai, Fang Zhang, Huibin Chen, Fuquan Jiang, Hui Fang, Shanjun Yang, Jie Liu, Maria T. Diaz-Meco, Ying Su, Hu Zhou, Jorge Moscat, Xiangzhi Lin, Xiao-kun Zhang*. Celastrol-Induced Nur77 Interaction with TRAF2 Alleviates Inflammation by Promoting Mitochondrial Ubiquitination and Autophagy. Molecular Cell, 2017, 66(1): 141-153. e6.

4. Dan Xu#, Lijun Cai#, Shangjie Guo, Lei Xie, Meimei Yin, Ziwen Chen, Hu Zhou, Ying Su, Zhiping Zeng*, Xiaokun Zhang*. Virtual screening and experimental validation identify novel modulators of nuclear receptor RXRα from Drugbank database. Bioorganic & Medicinal Chemistry Letters, 2017, 27(4): 1055-1061. *

5. Lei Xie#, Fuquan Jiang#, Xindao Zhang, Gulimiran Alitongbieke, Xinlei Shi, MinJun Meng, Yiming Xu, Anshi Ren, Jing Wang, Lijun Cai, Yunxia Zhou, Yang Xu, Ying Su, Jie Liu, Zhiping Zeng, Guanghui Wang, Hu Zhou, Quan Cheng Chen*, Xiao-kun Zhang*. Honokiol sensitizes breast cancer cells to TNF-α induction of apoptosis by inhibiting Nur77 expression. British Journal of Pharmacology, 2016, 173(2): 344-356.  

6. Jing Wu, Xiulai Chen, Lijun Cai, Lei Tang, Liming Liu*. Transcription factors Asg1p and Hal9p regulate pH homeostasis in Candida glabrata. Frontiers in Microbiology, 2015, 6. 

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孙华琴 硕士

技术员,硕士,毕业于福建医科大学基础医学院。2020至2023期间在福建医科大学协和医院血液病学转化医学中心任科研助理。擅长Illumina高通量基因测序仪的管理及生信数据分析和处理,研究方向涉及多种肿瘤生物标志物的生信分析,和褪黑素及其受体与肿瘤之间的关系研究。

已发表文章:

1. Yi Zou#, Huaqin Sun#, Yating Guo#, Yidan Shi , Zhiyu Jiang, Jingxuan Huang, Li Li, Fengle Jiang, Zeman Lin, Junling Wu, Ruixiang Zhou *, Yuncai Liu*, Lu Ao*. Integrative Pan-Cancer Analysis Reveals Decreased Melatonergic Gene Expression in Carcinogenesis and RORA as a Prognostic Marker for Hepatocellular Carcinoma. Frontiers in Oncology 11(2021):643983.

2. Lu Ao#, Li Li#, Huaqin Sun#, Huxing Chen, Yawei Li, Haiyan Huang, Xianlong Wang, Zheng Guo, Ruixiang Zhou*. Transcriptomic analysis on the effects of melatonin in gastrointestinal carcinomas. BMC Gastroenterology 20.1(2020).

3. Jianhua Luo#, Zhiguang Zhang#, Huaqin Sun, Jun Song, Xuzheng Chen, Jingxuan Huang, Xiuping Lin, Ruixiang Zhou*. Effect of melatonin on t/b cell activation and immune regulation in pinealectomy mice - sciencedirect. Life Sciences, 242.

4. Yifeng Shen#, Mengsha Tong#, Qirui Liang, You Guo, Huaqin Sun, Weicheng Zheng, Lu Ao, Feifei She*, Zheng Guo*. Epigenomics alternations and dynamic transcriptional changes in responses to 5-fluorouracil stimulation reveal mechanisms of acquired drug resistance of colorectal cancer cells. The pharmacogenomics journal, 2018, 18(1): 23-8.

5. HaiYan Huang#, Yi Zou#, Huarong Zhang, Xiang Li, Yawei Li, Xusheng Deng, Huaqin Sun, Zheng Guo, Lu Ao*. A qualitative transcriptional prognostic signature for patients with stage I-II pancreatic ductal adenocarcinoma. Translational Research 219(2020):30-44. 

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许万里 硕士

技术员,硕士,毕业于福州大学生物科学与工程学院。2020至2023期间在香港大学深圳医院从事科研技术员工作,获多项国家专利及技能证书,其研究涉及肿瘤药物毒性研究和肿瘤标志物筛选,以及IVD行业病毒检测和试剂开发。主要实验技能有流式细胞术、激光共聚焦显微技术及高效液相色HPLC分析等。

已发表文章及授权专利:

1. Wanli Xu, Linyu Ma, Zhibing Liang, Caining Zhao,et al. Palliative Radiotherapy Decreased K+ and Ca2+ of the Blood in Patients With Stage IV Lung Cancer. Journal of Thoracic Oncology; Oct. 2021, S1077-S1077.

2. Xiaozhen He, Wenfeng Chen, Zhen Liu,Guirong Yu, Youbang Chen, Wanli Xu,.Qiang Sun, Yufeng Yang. Efficient and risk-reduceouble nicks enhanced by bacterial recombination factors in multiple species; Nucleic Acids Res.; 30 March 2020, e57, PMCID: PMC7261186.

3. CN110607399B,用于LAMP扩增以检测HPV和分型的引物组合、试剂盒和方法,已授权发明专利。

4. CN210945601U,一种用于LAMP扩增以检测基因分型的微流控芯片,已授权实用新型专利。